The C. elegans ORFeome cloning project
| Sequencing information (OST): | |
| OST in ORFeome version 1 confirms ORF (WS9) | |
| OST in ORFeome version 3 does not confirm repredicted ORF (WS100) | |
| See below for graphical display | |
| ORFeome 3 | |
| ID (wormbase WS100): Y4C6B.6 | size: 1560 |
| Original Position: 30004@C07 | chromosome: IV |
Forward primer: ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggcttgattttgaatatatccgtttctttgc Reverse primer: ggggaccactttgtacaagaaagctgggtatttataaacaattgtaatcagtgaattcggt Predicted Sequence: atgattttgaatatatccgtttctttgctaatatttctggcgttttatggattttcaagcgatgcaaagtcccttccttg ctccgaagtgaagaaagagtatggaatagtttgtcgttgcaatgccacgtattgtgatacaattgaaccacttggaactg ttacttctgggaaagcagttgtctatacaacatcaagaaatggaaaaagaatgaacagaagtgaattgaagcatacaact tcttctacagccaaaacaaaagtatatgtgaacacaactcaaagttttcaaccggtaatgggatttggagctgcattcac tgatgctgctggaattaatatgaagatgctgccacagacaatgcaagatcaaattattcagcaatacttttccgatgatg gtctcgggtatgtttttggacgagttccaatggcttcaactgacttttcaactcacgagtacagttatgacgacgttaaa tttgattttgatctcaaaaatttcaatttaacagtggaagatctccagtataaaattccatttatcaagaaggcaatgac agcttctggagggaaattaaagctatttgcaactccatggagctccccaggatggatgaaaacttctggaagaatggttg gtgccggagagctattgggagatcagaatggaaaatactatcagacatgggcacagtactttgtaaaattcttcgaagcc tatcacgctcaaggtattgacttttggtctttgacaccacaaaacgagccaacaactggaattgatccactttggaaatg gcaaacactctttttcgatgcatcaatggaacgaaattttataaagaaacttttgggaccagcacttgcttcatcaccag tgactaagaatttgaagattatgattaatgatgatcagagaattaatttgccacactggccaaatgtaattttaacggat ccaactgctgctcaatacgtccacggaattgcaattcattggtatgaagacttcattgacccagcaaccgtactcactga aactcacgagaagttcccagactatttccttttggcaactgaagcatgtgctggatacttcccagcagatggaccaaaat tgggatcatggtctagagctgaacaatatgcaaatgatttgattaaagatatgggaaattgggttggaggatgggttgat tggaattatattcttgatttacaaggaggaccaaatcttgccaaaaactttgtcgattcaacaataatcgtgaatgcaac tgctcaagagtactacaaacaaccaatttggcatgtaatggctcaattcagtaaatttgtgaaaccgggagctattcgtg ttggaataaacattattgagaaatcagttgatgttgagggtctttcatttttgaatcaagatggtaccaaaactgtggtt ttattgaataaaaatgaggtactcagcttcgacgtggcaatcagtgacgtcagtgctccaaatgtgatctatgatttgac aatccaaccgaattcactgattacaattgtttataaataa | |
| ORFeome 1 | |
| ID (wormbase WS100): Y4C6B.6 ID (WS9): Y4C6B.d | size: 2528 |
| In Frame version 1: Y | chromosome: IV |
| Original Position: 10090@B8 | Clone available in well 11023@G08 at Open Biosystems and MRC geneservice (see OST) |
| ORF is available as RNAi clone in GHR-11023@G08 | |
Forward primer: ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggcttgggatttggagctgcat Reverse primer: ggggaccactttgtacaagaaagctgggtatttataaacaattgtaatcagtgaattcgg Predicted Sequence: atgggatttggagctgcattcactgatgctgctggaattaatatgaagatgctgccacagacaatgcaagatcaaattat tcagcaatacttttccgatgatggtaagttattttcaaaagattaagcttgaaaaataaataatttaggtctcgggtatg tttttggacgagttccaatggcttcaactgacttttcaactcacgagtacagttatgacgacgttaaatttgattttgat ctcaaaaatttcaatttaacagtggaagatctccagtataaaattccatttatcaagaaggcaatgacagcttctggagg gaaattaaagctatttgcaactccatggagctccccaggatggatgaaaacttctggaagaatggttggtgccggagagc tattgggagatcagaatggaaaatactatcagacatgggcacagtactttgtaaagtaagttcttattttcaaagaaata aaaaataaaattataaaatgaaagattcttcgaagcctatcacgctcaaggtattgacttttggtctttgacaccacaaa acgagccaacaactggaattgatccactttggaaatggcaaacactctttttcgatgcatcaatggaacgaaattttata aagaaacttttgggaccagcacttgcttcatcaccagtgactaagaatttgaagattatgattaatgatgatcagagaat taatttgccacactggccaaatgtagtaagttattggtgggataaaacattgagtaataggtagaaatgattgaatgact aaaaattaattagatactgtttcacattcaaaataaatatattaaaattataaacaaaacagtaatccaatacgagaaac aaaacctcttttatttattgaaaattttcaaaacttttatagctctttcctttgtttatttttttgttttctattaggta cttaccgttttttaacactattaagactccattgtaattaagtattttcgaatttttttcgaatcaagacactagaacgg ttattttaattttaaaactcgctttcacctacaattattactgaattgaccgaatagttcaacagttgtgtaaattgttt tagaaaaaattaaaatcgaacgacaaaatgtgcaaaactgataagaaacgtaatgctaaaatggatttgttgaaacattg aaacatatcagatattcaaaaattgtactgtttcacattcaaaataaatatatatatagaaattataaacaaaacagtcg aaacaaaagtactgtttttgggaatcaaaattgaggtatttttgagctttccgtagtctttggtaaattatgaaacaaag tgtaatgaagtatttattgactaattgttagaatttgaagattatgatgaatgataatcaggaaattattttgccaaatt ggccaaatgtggtgagttgtcgttttgttgaaacagttatgcaacagtagggaaaaacataaaataatcaaactttgtgc tgttttacattcaaaataaatataagaaaattattattgccatcaatctttctttggccttgggaagagttatccgcaga atttacctatttgaatttttaacccttgattaaaaatcatatcccattccgacgtccccactcttttaaaataaaatttt agattttaacggatccaactgctgctcaatacgtccacggaattgcaattcattggtatgaagacttcattgacccagca accgtactcactgaaactcacgagaagttcccagactatttccttttggcaactgaagcatgtgctggatacttcccagc agatggaccaaaattgggatcatggtctagagctgaacaatatgcaaatgatttgattaaagatatgggaaattgggttg gaggatgggttgattggaattatattcttgatttacaaggttggtttgtgaagtgtagcaacacttgcgattttttaatt taaaaacatcaaaaaccatagtaagaaacagatttagaattttaaatctttgatataactaggttgaaacagttttctaa tatttattttccaggaggaccaaatcttgccaaaaactttgtcgattcaacaataatcgtgaatgcaactgctcaagagt actacaaacaaccaatttggcatgtaatggctcaattcagtaaatttgtgaaaccgggagctattcgtgttggaataaac attattgagaaatcagttgatgttgagggtctttcatttttgaatcaagatggtaccaaaactgtggttttattgaataa aaatgaggtaatttaatcaaaaagagataatccaacatggaattatttatagttctagtttattaaattttagaaacagt aaaacaaatttttatccaaacttcaggtactcagcttcgacgtggcaatcagtgacgtcagtgctccaaatgtgatctat gatttgacaatccaaccgaattcactgattacaattgtttataaataa | |
| ORFeome 1 | |
| ID (wormbase): Y4C6B.6 | size: 1527 |
| Original Position: 10085@H1 | chromosome: IV |
Forward primer: ggggacaagtttgtacaaaaaagcaggcttgaaaagtttctactgctccgaggtaa Reverse primer: ggggaccactttgtacaagaaagctgggtatttataaacaattgtaatcagtgaattcggt Predicted Sequence: atgaaaagtttctactgctccgaggtaaaaaaaaagtcccttccttgctccgaagtgaagaaagagtatggaatagtttg tcgttgcaatgccacgtattgtgatacaattgaaccacttggaactgttacttctgggaaagcagttgtctatacaacat caagaaatggaaaaagaatgaacagaagtgaattgaagcatacaacttcttctacagccaaaacaaaagtatatgtgaac acaactcaaagttttcaaccggtaatgggatttggagctgcattcactgatgctgctggaattaatatgaagatgctgcc acagacaatgcaagatcaaattattcagcaatacttttccgatgatggtctcgggtatgtttttggacgagttccaatgg cttcaactgacttttcaactcacgagtacagttatgacgacgttaaatttgattttgatctcaaaaatttcaatttaaca gtggaagatctccagtataaaattccatttatcaagaaggcaatgacagcttctggagggaaattaaagctatttgcaac tccatggagctccccaggatggatgaaaacttctggaagaatggttggtgccggagagctattgggagatcagaatggaa aatactatcagacatgggcacagtactttgtaaaattcttcgaagcctatcacgctcaaggtattgacttttggtctttg acaccacaaaacgagccaacaactggaattgatccactttggaaatggcaaacactctttttcgatgcatcaatggaacg aaattttataaagaaacttttgggaccagcacttgcttcatcaccagtgactaagaatttgaagattatgattaatgatg atcagagaattaatttgccacactggccaaatgtaattttaacggatccaactgctgctcaatacgtccacggaattgca attcattggtatgaagacttcattgacccagcaaccgtactcactgaaactcacgagaagttcccagactatttcctttt ggcaactgaagcatgtgctggatacttcccagcagatggaccaaaattgggatcatggtctagagctgaacaatatgcaa atgatttgattaaagatatgggaaattgggttggaggatgggttgattggaattatattcttgatttacaaggaggacca aatcttgccaaaaactttgtcgattcaacaataatcgtgaatgcaactgctcaagagtactacaaacaaccaatttggca tgtaatggctcaattcagtaaatttgtgaaaccgggagctattcgtgttggaataaacattattgagaaatcagttgatg ttgagggtctttcatttttgaatcaagatggtaccaaaactgtggttttattgaataaaaatgaggtactcagcttcgac gtggcaatcagtgacgtcagtgctccaaatgtgatctatgatttgacaatccaaccgaattcactgattacaattgttta taaataa | |
